У факультета сложились партнерские отношения с механико-математическим факультетом МГУ им. М.В. Ломоносова, Математический институт им. В.А. Стеклова РАН; Санкт-Петербургский государственный университет; Институт математики СО РАН (Новосибирск, Россия); Новосибирский государственный университет; Массачусетский технологический университет (США); Институт Макса Планка (Бонн, Германия); Университет Лион – 1 (Лион, Франция); Университет Манитоба (Виннипег, Канада); Кардиффский университет (Англия); Университет Сан-Пауло (Бразилия); Университет Гонконг (Гонконг); Миланский университет (Милан, Италия); Королевская Академия докторов (Барселона, Испания); Международная ассоциация математического моделирования (AMSE, Париж, Франция); АН Чехии (Прага, Чехия); Университет Лулео (Швеция); Токийский государственный университет (Токио, Япония).
Совместная подготовка Ph.D докторантов
Ø Московский государственный университет им.М.В.Ломоносова (профессора Шкаликов А.А., Дьяченко М.И.);
Ø Технологический университет Лулеo (Швеция, профессор Ларс-Ерик Персон);
Ø Университет Падуа (Италия, профессор Массимо Ланца де Кристофорис);
Ø Центр математических исследований (Испания, профессор Тихонов С.Ю.);
Ø Университет Измира (Турция, профессор Алемдар Хасаноглы);
Ø РУДН (Россия, профессора Степанов В.И., Гольдман М.И., Буренков В.В. );
Ø Университет Быдгош (Польша, профессор Скворцов В.А.);
Ø Берлинский свободный университет (Германия профессор Бегер Г);
Ø Университет Фридриха Шиллера (Йена, Германия, профессора Ханс Юрген Шмайссер, Зикель Винфред);
Ø Университет Южной Каролины (США, профессора В.Н.Темляков, К.И.Осколков);
Ø Государственный университет Уейн (Детройт, США, профессор Л.Макар- Лиманов).
Ø Сциньзянский университет (Урумчи, Китай, профессор Турдыбек Бекжан );
Ø Бакинский государственный университет и институт прикладной математики (Баку, Азердбайжан, Алиев Фикрет)
Ø Университет Ферат (Турция, Пенахов Етибар)
Надо отметить, что с 2008 года в рамках международного сотрудничества осуществляется защита магистерских и докторских диссертаций по программе подготовки PhD в зарубежных вузах: Технологическом университете Лулеo (Швеция), Берлинском Свободном университете (Германия), Университете Падуа (Италия). По итогам защиты получают зарубежные дипломы. С 2008 года защитились 8-магистрантов и 14-докторантов по программе PhD.